桓温在第二次北伐成功收复洛阳之后声望更高,先后进爵南郡公、大司马、都督中外诸军事、录尚书事,掌握全国的主要兵力,权倾朝野,谢安对此十分担忧。
不久晋穆帝司马聃去世,司马丕继位。
燕国的慕容恪杀死沈劲,然后命人厚葬。燕军乘势攻下了整个河南,与两淮连成了一片,向南与晋国以淮河为界,此时实力最强的国家是燕国、秦国和晋国,几乎三分天下,但是燕国成为三国中实力最强的一个。由于燕国的强大,给晋国造成很大的威胁,晋国的朝廷一方面要防止桓温的专权和谋反,另一方面又不得不用桓温去防着燕国。
朝廷虽然让桓温入朝参政,但是桓温不愿受入朝的限制,于是迁到姑孰,桓温把自己的人全部放到重要位置。
有一天,桓温又找算卦的测算晋国的运道,算命的说晋朝还可以延续上百年,桓温很不快活。谢安知道桓温私下里测国运后,知道桓温早有不臣之心,更加担忧晋朝的命运,只好苦思挽救之策。
公元365年,晋哀帝司马丕因病去世迷信黄老之术,天天炼丹,结果适得其反,死的更早了。桓温十分迷信,从算命的那里知道现在不是自己做皇帝的时机,所以没有谋反。朝廷拥立司马奕为帝。