更有甚者，护民官鲁西阿斯·泰提拉斯反对凯撒的一切提案，威胁道，如果凯撒的人想耗尽公库，他个人将起而卫护。凯撒不得不将这不可侵犯的人置于一旁。不过，他总尽可能避免采取暴烈的手段。他向元老院宣布（正如立宪派不久前所做的）他希望借助最高机关做合法统治，但由于这个帮助遭受拒绝，他可以不用。
于是他不再顾及元老院及合法形式，而指令次执政官马卡斯·艾米利阿斯·雷庇达斯为首都的城守，对服从他的各行省做了治理上的安排。即使在这巨人之战的混乱中，即使凯撒做了种种宽大的诺言，当首都的众民看到专制君主在他们自由的罗马挥舞着君主的权柄，看到他率同他的士兵打开国库的大门时，也内心有所凄凄。但人民的情感决定国事的时代已属过去。决定权在军团，受伤的情感已经并不算重要了。
凯撒急于重启战端，因为他不想放弃令他成功的先发制人的攻势。他的对手处境十分不利。庞培原想从意大利与西班牙夹攻高处，因凯撒的速战而遭挫折之后，庞培想前往西班牙。在那里，他的地位非常巩固。步兵达七个军团之众，其中有许多庞培的老战士，而勒西坦尼亚山区的长年争战则对官兵均有所历练。其军官之中的马卡靳·瓦罗是著名学者，忠诚的党员；鲁西阿斯·阿夫兰尼阿斯则不论在东方或在阿尔卑斯山，均有过优越战功，而马卡斯·佩特里阿斯则是凯特林的征服者，精干而无畏。在远西班牙省，由于凯撒曾任总督，固然尚有拥护者，但地位更为重要的艾布罗省，则因对庞培的尊敬与感谢而与之有密切关系，20年前，在塞托利亚之战中，庞培曾任司令，战后又曾将该省予以重组。
在意大利的大败以后，庞培最好的办法便是带领他剩余的部队前往西班牙，再率领整个西班牙大军回攻凯撒。但不巧为了挽救考菲尼阿，他在阿普利亚滞留过久，以致无法按原订计划在坎班尼亚的港口登船，却改在阿普利亚附近的布隆底西安。这个海洋与西西里的主人为什么不重拾其原本计划，现在已无从考证。也许是那些短视而狐疑的贵族不敢把自己交在西班牙军民手中。姑不论原因如何，庞培事实上是一直留在东方，而凯撒则有两条进攻的途径可取；他可以攻取在希腊组成而由庞培亲自指挥的军队，也可以攻由庞培的副官所率领的西班牙军。凯撒决定进攻后者。在意大利战结束后，他即召集隆河下河他最好的九个军团，六千骑兵——一部分是凯撒在塞尔特区域亲自挑选的，一部分是日耳曼佣兵——和相当多的伊比利亚兴利格利亚弓箭手。
但他的对手也积极备战。鲁西阿斯·杜米西阿斯在获凯撒释放之后，立即带同随员及鲁西阿斯·维布利阿斯·乐博斯至马西利亚（马赛），迫使该城宣布站在庞培一边，并拒绝凯撒部队通过。在西班牙军方面，最不可信赖的两个军团由瓦罗率领，驻于远西班牙省，而阿夫兰尼阿斯与佩特里阿斯则率领最精锐的五个军团，由四万西班牙步兵五千西班牙骑兵加强，向北进发。依照维布利阿斯所传达的庞培命令，他们的目标是封锁庇里牛斯山，以防敌人。
同时，凯撒已到高卢，由于马西利亚之围对他产生阻碍，他立刻命令他在隆河的大部分部队——六个军团，另有骑兵——沿大道经纳波（纳朋）去罗得斯，以便抢先抵达庇里牛斯。行动成功。当阿夫兰尼阿斯与佩特里阿斯到达隘口时，发现均由凯撒部队所占。于是他们在伊乐达（勒利达）布阵，此镇位于庇里牛斯山与艾布罗河之间，距艾布罗河二十英里，在其支流西考利斯（塞格利）河右岸，只在伊乐达附近有一座桥梁可通。伊乐达之南，山峦自艾布罗河右岸延伸至镇郊；北方则在西考利斯两岸均系平原，平原之上则为小山，而伊乐达镇便建于此山。
对于一支要被围攻的军队，这是一个优良的位置。但一旦庇里牛斯山失守，西班牙的防卫战却必须退到艾布罗河的后方始可积极从事。由于伊乐达成艾布罗之间尚未建立起安全的路线，而艾布罗河又未有桥梁，因之从这暂时的防御位置至真正的防御位置便没有安全的退路。凯撒的部队扎营于伊乐达的上游斯考利斯河与辛伽河之间的三角洲上，而此二河于下游伊乐达之处会合。但攻势在凯撒到达以后，于6月23日才积极展开。在伊乐达的城墙之下，两军数度决战，而各有胜负。然而，凯撒军的目标——攻入敌军与该镇之间，因而攫取石桥——却终未成功。因之他们同高卢之间的联系便只能依赖于西考利斯河上游十八或二十英里处匆忙搭起的两座桥。因为在伊乐达城边水势太大，无法架桥。
山区融雪造成的洪水将此二桥冲毁。由于水势高涨，无法行舟，而桥梁的复修暂不可能，凯撒军乃受困于辛伽与斯考利斯之间的狭地；这支部队及其与高卢和意大利的陆地道路也几乎毫无屏障的暴露于庞培军的攻击之下，后者渡河靠镇桥，或用勒西塔尼亚人之法，在浮皮上游泳而过。此时正值秋收前期，旧谷用罄，新谷未集，在两河之间的狭地上，迅即缺粮。军营中则实际已闹饥荒（小麦一摩底阿斯价钱50德纳瑞），而危险的疾病也传染开来。左岸则累积了丰富的供应品与兵源——由高卢增援而来的骑兵与弓箭，休假归队的官兵，征粮回来的部队——总共六千人。庞培的优势兵力驱逐左岸的这支部队入山，造成重大损失，而右岸主力则只能愤愤的看着这场兵力悬殊的战斗。
如是，军队的通衢握在庞培部队掌中。在意大利，西班牙的报告突然中断，谣言蜂起，而离事实并不甚远。如果庞培部队掌握有利时机，必可将左岸凯撒部完全击溃，至少可以将其驱回高卢，而完全制御此岸，使彼岸的凯撒部绝无偷渡机会。但两者均未达成。那孤立的部分既未遭击溃，也未完全被迫同，而渡河的防止工作则完全交给河流本身去执行。
于是凯撒拟定他的计划。他下令在军营中用轻木框、柳条与皮带编成木筏，如早先布立顿人、其后撒克逊人在英伦海峡所用者。造好，用车辆运至原先的临时桥梁所在之地。就靠这些脆弱的浮木，部分人员未遭抵抗而达到对岸。未经多大困难将桥重新建起，与之相连的道路迅即肃清，亟须的供应品运至军营。凯撒巧妙的念头如是将全军挽救于毁灭边缘。接着，战力远优于敌人的凯撒骑兵开始穿梭于斯考利斯河左岸之村野。庇里牛斯山与艾布罗河之间，最重要的一些西班牙社团，甚至艾布罗河以南的数个，均转入凯撒一边。
庞培部队的军需员，由于邻近社团的背离与凯撒部队的征粮而大量锐减。他们决定退至艾布罗河之后，于是，急急在西考利斯河河口下方搭建横越艾布罗河的船桥。凯撒试图切断敌军在艾布罗河的退路，将他们留困于伊乐达。但由于敌军据有伊乐达桥，因之他既不能派兵至该河两岸，也无法进犯伊乐达。于是他的部队日夜赶工，挖掘水渠，以疏浅河水，使步兵得过。但庞培军的准备工作较凯撒军的提早完成。当前者已沿西考利斯左岸向艾布罗前进时，水渠工程的进度似尚不足允许步兵涉过。因此只有下令骑兵过河追击敌后。
但当凯撒的士兵在灰白的晨光中眼见自半夜即开始撤退的敌人队伍时，他们老兵的本能立即见出其战略上的重要性，因为这样的撤退必将迫使凯撒军深入远方敌阵。在士兵自动的要求下，凯撒乃身先士卒，率步兵涉水过河，尽管水深及肩，而幸无意外。时间正好。如果伊乐达镇与合抱艾布罗河山岭之间的狭窄平原被庞培军越过，则其移军艾布罗河之举即再无法阻止。凯撒骑兵军连连骚扰，庞培军却已到达山区五英里之内，而不幸，在从半夜启程行军后，至此已疲惫不堪，乃决定放弃其最初计划，不于一日之内抵达目的地，却半途扎营。至夜，凯撒步兵追及，亦在其对方扎营。庞培部本拟夜行军，因恐敌军骑兵袭击而放弃。第二天，两军均按兵不动，仅勘察附近村野而已。
第三天清早，凯撒步兵开始穿越路边山区，以阻断敌军至艾布罗的退路。这次行军路线迂回，看似重返伊乐达前的军营。因之未为庞培部队军官立即察觉。当他们看出敌人意图时，乃牺牲军营与行李，沿公路强行军，想在凯撒军之前到达山脊，然已为时太晚：当他们到达时，敌军已在公路上布阵以待。庞培部复图由陡峭山径翻至艾布罗，但为凯撒骑兵所挫，负此任务的勒西塔尼亚人部队溃散无余。
设若凯撒部与庞培部此时发生战斗，则结果必至庞培部全军溃灭——在前有步兵后有骑兵的态势下，庞培部已士气瓦解——而战胜的机会也有数次自行呈现，但凯撒不加利用，而尽量安抚其磨拳擦掌急于一战的士兵。无论如何，庞培部在战略上已败，凯撒不拟再损失自己的兵员，徒增两军仇恨。在他切断庞培部至艾布罗河退路的次日，两军的士兵即开始友善联系，谈判投降事宜。事实上，庞培军的要求，尤其是军官的免罪，已得凯撒应允，而正在这时，佩特里阿斯却带着由奴隶与西班牙人组成的卫队至谈判处，将能够捉到的凯撒部下一律处死。然而来到凯撒营中的庞培军仍旧不予任何伤害而送回本营；凯撒仍然坚持和平解决。
庞培部在伊乐达仍留有卫戍部队和相当数量的供应品。现在，他们想回返该处；但前有敌军，而西考利斯河又横阻于后，因之无法接近目的地。他们的骑兵变得如此恐慌，以致步兵不得不把他们置于中央，自任后卫。水与食粮的征集越来越为艰困，只得把无粮草喂养的驮兽屠杀。最后，这支无所适从的部队正正式式的被围于西考利斯河与敌人之间，敌人更在其外围筑起土堤掘出壕沟。他们想渡河，但凯撒的日耳曼骑兵与轻步兵抢先过河，占据对岸。
不论何等的忠诚与勇敢，也再无法拖延投降的时刻了——于是，公元前49年8月2目，乃正式投降。凯撒不但给予官兵生命、自由与仍旧存留的财产，并把从他们那里所得的战利品均悉数归还，而对本军官兵则应允将来以个人财产赔偿。在意大利俘虏的新兵，他强迫他们加入本军，但对庞培的老兵，他却不强迫任何一个违背其个人愿望服务于凯撒。他只要求他们放下武器回家。据此，三分之一的庞培军队——西班牙本地人——立即解散，意大利人则于阿尔卑斯山南与山北高卢之间遣散。
在庞培的军队解散之后，近西班牙落入凯撒之手。远西班牙，庞培的部队则由马卡斯·瓦罗统领。当他听到伊乐达的惨况之后，认为最好的办法是退入岛城伽底斯，把从神庙与富有的凯撒派家庭充公的财产运至该城，并率领他征集的充实舰队，以及交托予他的两个军团。但在凯撒已到的风声初传之际，该省最重要的一些城镇——早先就倾向于凯撒的，如科杜巴，卡莫与伽底斯——就把庞培卫戍部队赶走，或唆使他们叛变。瓦罗的两个军团之一早已自行前往西斯巴利斯，连同该镇一起投向凯撒。最后，当意大利卡也对瓦罗关闭城门的时候，他才决定投降。马西利亚也约在同时投降。
公元前49年，凯撒另得两次胜利，一次重大的失败。昆塔斯·瓦勒利阿斯取下萨丁尼亚·盖阿斯·丘利欧取下西西里，打破了庞培以海军封锁饥困意大利的计划。但丘利欧进一步的远征非洲却只初步成功，不久即为庞培的盟友红米底亚的朱巴王包围，丘利欧与其部队全遭歼灭。
公元前49年的这些事件，对庞培的总作战计划有多大的影响，在意大利尽失之后，他对西班牙部队又交付了何等重要任务，我们现在都只能凭猜测。庞培意欲由非洲及毛利塔尼亚前往西班牙，驰援他在该处的部队，纯属妄想，无疑也是伊乐达军营中流传的谣言而已。可能性比较大的是，他仍抱原先的计划，即使在意大利尽失以后，他也可以从阿尔卑斯山南北高卢夹攻凯撒，并试图由西班牙与马其顿合攻意大利。他本意可能要西班牙军驻守庇里牛斯山待马其顿的部队整备完成。于是，两军同时出发，于隆河或波河会师，而舰队则可能负责攻取意大利本部。
凯撒就以这种推测而预料意大利的战事。在这个本土上，他最干练的军官之一，马卡斯·安东尼阿斯以预备部队备战。东南港口西帕斯、布隆底西安与塔伦腾预料可能有敌军登陆，因之派遣三个军团备战。此外，昆塔斯·贺坦西阿斯——此人放荡不羁，其父为著名演说家——征集一支舰队，驻守于第勒尼安海；普布利阿斯·杜拉贝拉率第二支舰队驻守于亚德里亚海，其目的一为支持意大利的守备，一为将来运输远征军至希腊。如果庞培部队进攻意大利，则马卡斯·李辛尼阿斯·克拉苏——其父为凯撒的老同事——则负阿尔卑斯山南高卢防御之责，马卡斯·安东尼阿斯的弟弟则负责伊利里坎的防卫。
但预料中的进攻却迟迟未到。至公元前49年仲夏，战斗才开始于伊利利亚。凯撒副将盖阿斯率两个军团守卫克利克塔岛（昆纳罗湾的维吉利亚），凯撒的舰队司令普布利阿斯·杜拉贝拉则率战船四十艘巡逻于此岛与大陆之间的狭长海域。庞培在亚德里亚海的两名舰队司令，马卡斯·奥大维率希腊舰队，鲁西阿斯·斯克里本尼阿斯·李波率伊利利亚舰队，攻击杜拉贝拉的中队，悉数毁之，因而将安东尼阿斯困扰于克里克塔岛。为了解救他，巴西拉斯与撒勒斯西阿斯的部队从意大利驰援，贺坦西阿斯的战船中队也从第勒尼安海前往。但两者在敌方的优势海军面前均不能发挥任何救援之功。
安东尼阿斯的两个军团只得听天由命。供应品已经告罄，部队开始怨愤而有叛变倾向。除却几个小队用木筏浮至大陆外，其它部队——仍有十五个步兵队——放下武器，被运往马其顿，编入庞培队伍，奥大维则留下，完成再无防卫力的伊利利亚海岸的降服工作。这一带最强大的部族达尔玛泰，岛城伊撒（利撒）及一些其他城镇投向庞培。但凯撒的拥护者却在撒隆奈（斯帕拉托）与利撒斯（阿勒斯欧）坚守下去；前者不但在极艰困的情况下于围城中奋战，甚至发动了一次十分猛烈的突围，以致奥大维撤兵而去，扬帆至德拉丘姆度冬。
