学园都市由统括理事会会长亚雷斯塔·克劳利花费数十年建立。位于日本国东京西部（也包括埼玉县和神奈川县一部分）的圆形城市，其陆地亦被日本包围。
人口230万人，八成的居民超过180万都是学生。学园都市拥有世界上最尖端的科技，比外界先进二三十年是科学世界的领导者，有各种类型不同的能力，以范围和威力分为无能力者、低能力者、异能力者、强能力者、大能力者、超能力者、绝对能力者。
学园都市的夜晚早已降临，矗立着许多高楼的雪菊被黑暗和寂静照着，只有街边几座路灯亮着，空暗光时不时传出远处飞机引起了轰鸣声。
“BOOM！”震耳欲聋的爆炸声打破了这片寂静。在第七学区内，某一实验室内一个白色头发的少年和一个灰色头发的少年正在摧残着实验室这就是我们的主角井上川一和一方通行了，“喂001号，你要摧毁到什么时候”井上川一向一方通行说道“你在怕吗，002，不过没关系毕竟这可是恶党做的东西啊哈哈哈哈”一方通行满不在乎的说道，就这样俩人继续开始着屠杀，直到一个红色头发，胸部由绷带绑着的女孩来到他们面前说道没错，这就是结标淡希了“我是引路人，亚雷斯坦理事长要见你们，请跟我走一趟”结标淡希说道“你有资格问我话吗啊！谁要和你去见那个什么理事长啊！”一方通行说着就要动手了只见一只白皙的手搭在一方通行肩膀上说道“001，别那么大脾气，走吧去见见所谓的理事长！”井上川一说道“切，也只有你能碰到我了，否则我一定会弄死你的”一方通行似乎平静了一些，这时只见结标淡希拿出一个手电筒一晃三人就来到一个密封的空间内，只见一个人倒吊在一个容器里，这个人既像老人又像小孩，既像女人又像男人，既像圣人又像罪人，他就是建立都市的人——亚雷斯坦?克劳利，他突然张开眼说道
“井上川一和一方通行是吧，这次叫你们来主要是因为你们的之后归属问题，一方通行，我会给你一个房子和一个身份的，你就去长点上机，而你井上川一，你就去某高中吧，去当一个老师，我也会给你一个住所的，而你们的称号就是No.1的一方通行和No.8的绝对防御了”
说着把一些东西给了一方通行和井上川一了，看着俩个孩子离开了亚雷斯坦的身前出来一个幻影
“这可不像啊亚雷斯坦”
艾华斯戏谑的说道
“这有什么关系呢艾华斯，只要能利用的我都会利用跟何况那俩个孩子的能力尤其是井上川一的能力可是我们对魔神的一大王牌啊”
亚雷斯坦面无表情的说道，自此俩位少年的生活开始了
