登陆注册
8392100000032

第32章 参考文献(3)

86.Dang,L.X.,IntermolecularInteractionsofLiquidDichloromethaneandEquilibriumPropertiesofLiquid-VaporandLiquid-LiquidInterfaces:aMolecularDynamicsStudy,J.Chem.Phys.1999,110:

10113-10122.

87.Chang,T.M.;Dang,L.X.,MolecularDynamicsSimulationsofCCl4-H2OLiquid-liquidInterfaceWithPolarizablePotentialModels,J.Chem.Phys.1996,104:6772-6783.

88.Dang,L.X.,CharacterizationofWaterOctamer,Decamer,andIodine-WaterInteractionsUsingMolecularDynamicsTechniques,J.Chem.Phys.1999,110:1526-1532.

89.Dang,L.X.,ComputerSimulationStudiesofIonTransportacrossaLiquid/LiquidInterface,J.Phys.

Chem.B1999,103:8195-8200.

90.Dang,L.X.;Feller,D.,MolecularDynamicsStudyofWater-BenzeneInteractionsattheLiquid/VaporInterfaceofWater,J.Phys.Chem.B.2000,104:4403-4407.

91.Hermida-Ramon,J.M.;Rios,M.A.,ANewIntermolecularPolarizablePotentialforaFormaldehydeDimer.ApplicationtoLiquidSimulations,J.Phys.Chem.A1998,102:10818-10827.

92.Mannfors,B.;Palmo,K.;Krimm,S.,ANewElectrostaticModelforMolecularMechanicsForceFields.J.Mol.Struct.2000,556:1-22.

93.Ding,Y.;Bernardo,D.N.;Krogh-Jespersen,K.;Levy,R.M.,SolvationFreeEnergiesofSmallAmidesandAminesfromMolecularDynamics/FreeEnergyPerturbationSimulationsUsingPairwiseAdditiveandMany-bodyPolarizablePotentials.J.Phys.Chem.1995,99,11575-11583.

94.Gresh,N.;EnergeticsofZn2+BindingtoaSeriesofBiologicallyRelevantLigants:aMolecularMechanicsInvestigationGroundedonAbInitioSelf-ConsistentFieldSupermoleculeComputations,J.Comput.Chem.1995,16:856-882.

95.Gresh,N.;Garmer,D.R.,ComparativeBindingEnergeticsofMg2+,Ca2+,Zn2+andCd2+toBiologicallyRelevantLigants:CombinedAbInitioSCFSupermoleculeandMolecularMechanicsInvestigation,J.Comput.Chem.1996,17:1481-1495.

96.Garmer,D.R.;Gresh,N.;Roques,B.P.,ModelingofInhibitor-metalloenzymeInteractionsandSelectivelyUsingMolecularMechanicsGroundedinQuantumChemistry,Proteins1998,31:42-60.

97.Tiraboschi,G.;Roques,B.-P.;Gresh,N.,JointQuantumChemicalandPolarizableMolecularMechanicsInvestigationofFormateComplexeswithPenta-andhexahydratedZn2+.ComparisonbetweenEnergeticsofModelBidentates,Monodentate,andThrough-WaterZn2+BindingModesandEvaluationofNonadditivityEffects,J.Comput.Chem.1999,20:1379-1390.

98.Gresh,N.;Sponer,J.,ComplexesofPentahydratedZn2+withGuanine,Adenine,andtheGuanine-CytosineandAdenine-ThymineBasePairs.StructuresandEnergiesCharaterizedbyPolarizableMolecularMechanicsandAbInitioCalculations,J.Phys.Chem.B1999,103:

11415-11427.

99.Tiraboschi,G.;Gresh,N.;Giessner-Prettre,C.;Pedersen,L.G.;Deerfield,D.W.,ParallelAbInitioandMolecularMechanicsInvestigationofpolycoordinatedZn(II)ComplexeswithModelHardandSoftLigands:VariationsofBindingEnergyandofItsComponentswithNumberandChargesofLigands,J.Comput.Chem.2000,21:1011-1039.

100.Rogalewicz,F.;Ohanessian,G.;Gresh,N.,InteractionofNeutralandZwitterionicGlycinewithZn2+inGasPhase:AbInitioandSIBFAMolecularMechanicsCalculations,J.Comput.Chem.2000,21:963-973.

101.Wang,J.;Cieplak,P.;Kollman,P.A.HowWellDoesaRestrainedElectrostaticPotential(RESP)ModelPerforminConformationalEnergiesofOrganicandBiologicalMolecules,J.Comput.Chem.

2000,21:1049-1074.

102.Meng,E.C.;Caldwell,J.W.;Kollman,P.A.,InvestigatingtheAnomalousSolvationFreeEnergiesofAmineswithaPolarizablePotential,J.Phys.Chem.1996,100:2367-2371.

103.Stern,H.A.;Kaminski,G.A.;Banks,J.L.;Zhou,R.;Berne,B.J.;Friesner,R.A.,FluctuatingCharge,PolarizableDipole,andCombinedModel:ParameterizationfromAbInitioQuantumChemistry,J.Phys.Chem.B1999,103:4730-4737.

104.Banks,J.L.;Kaminski,G.A.;Ruhong,Z.;Mainz,D.T.;Berne,B.J.;Friesner,R.A.ParamitrizingaPolarizableForceFieldfromAbInitioData.I.TheFluctuatingPointChargeModel,J.Chem.

Phys.1999,110:741-754.

105.Kaminski,G.A.;Stern,H,A.;Berne,B.J.;Friesner,R.A.;Yixiang,X.C.;Murphy,R.B.;Ruhong,Z.;Halgren,T.A.,DevelopmentofaPolarizableForceFieldforProteinsviaAbInitioQuantumChemistry:FirstGenerationModelandGasPhaseTests,J.Comput.Chem.2002,23:1515-1531.

106.Gresh,N.;Guo,H.;Salahub,D.R.;Roques,B.P.;Kafafi,S.A.,CriticalRoleofAnisotropyfortheDimerizationenergiesofTwoProtein-proteinRecognitionMotifs:Cis-N-methylacetamideversusaBeta-sheetConformerofAlanineDipeptide.AJointAbInitio,DensityFunctionalTheory,andMolecularMechanicsInvestigation,J.Am.Chem.Soc.1999,121:7885-7894.

107.Dixon,R.W.;Kollman,P.A.,AdvancingbeyondtheAtom-centeredModelinAdditiveandNonadditiveMolecularMechanics,J.Comput.Chem.1997,18:1632-1646.

108.Patel,S.,Brooks,C.L.,III.CHARMMFluctuatingChargeForceFieldforProteins:I.

ParameterizationandApplicationtoBulkOrganicLiquidSimulations,J.Comput.Chem.2004,25:1-15.

109.Patel.S.,Mackerell,A.D.,Jr.,Brooks,C.L.,III.,CHARMMFluctuatingChargeForceFieldforProteins:II.Protein/SolventPropertiesfromMolecularDynamicsSimulationsUsingaNonadditiveElectrostaticModel,J.Comput.Chem.2004,25:1504-1514.

110.Ogawa,T.;Kitao,O.;Kuiita,N.;Sekino,H.;Tanaka,S.,ConsistentChargeEquilibrationMethodCombinedwithUniversalForceField:ApplicationtoAminoAcidMolecules,Chem-Bio.InformaticsJ.2003,3:78-85.

111.Ren,P.;Ponder,J.W.,PolarizableAtomicMultipoleWaterModelforMolecularMechanicsSimulation,J.Phys.Chem.B2003,107:5933.

112.Grossfield,A.;Ren,P.;Ponder,J.W.,IonSolvationThermodynamicsfromSimulationwithaPolarizableForceField,J.Am.Chem.Soc.2003,125:15671.

113.Ren,P.;Ponder,J.W.,ConsistentTreatmentofInter-andIntramolecularPolarizationinMolecularMechanicsCalculations,J.Comput.Chem.2002,23:1497-1505.

114.Thole,B.T.,MolecularPolarizabilitiesCalculatedwithaModifiedDipoleInteraction,Chem.Phys.

1981,59:341.

115.Mulder,F.;vanHemert,M.C.;Wormer,P.E.S.;vanderAvoird,A.,Theor.Chim.Acta.1977,46:

39.

116.vanHemert,M.C.;Blom,C.E.,Mol.Phys.1981,43:229.

117.Btcher,C.F.;Bordewijk,P.,TheoryofElectricPolarization,Elsevier:Amsterdam,1978.

同类推荐
  • 物理中的奥秘

    物理中的奥秘

    《物理中的奥秘》是一本专门为青少年编写的物理科普读物,它以一个个新鲜生动、引人入胜的物理故事,如冰箱为何会爆炸、他能推动地球吗、他抓住了飞行的子弹、金属也有记忆力、水能削铁如泥吗……在讲故事的同时,讲述一些物理原理和物理知识,寓教于乐,读起来津津有味,从而提高青少年读者对物理科学的兴趣,为青少年打开一扇扇科学的窗口,在阅读故事中满足青少年的好奇心。本书可供初中以上文化程度的青少年读者阅读使用,也可供一般读者使用。
  • 探究式科普丛书-干旱缺水的荒漠:沙漠

    探究式科普丛书-干旱缺水的荒漠:沙漠

    本书从各方面对世界各大沙漠进行了详细的描写,可以为读者提供一个知识平台,让广大青少年朋友更全面地了解沙漠。
  • 目标

    目标

    身为物理学家与企业管理大师的高德拉特博士,将物理学法则及逻辑推理的思维方法应用于企业管理,独创出可解决企业诸多问题的“制约法”,并以此写下了一系列企管小说,现已风靡全球。本书以一家工厂为背景,以苏格拉底式的问题为引线,伴随着书中受过专业技术及管理训练的厂长,一起经历坠入困境、从谷底爬起、化解压力、挑战和推翻被奉为圭臬却十分有害的管理概念的心路历程,找出行动与结果的因果关系,从而获得一种适用各种企业的、简单到接近常识的解决复杂管理问题的方法。
  • 求知文库-生物生态拾趣

    求知文库-生物生态拾趣

    本书为青少年读物,介绍了动物、植物、人与生态之间的关系和相互作用。以及保护环境的重要性。
  • 探索生命的奥秘

    探索生命的奥秘

    本书作者通过搜集整理了大量资料并通过自己慎密的思考,撰写了十几篇论文,并先后在有关杂志上发表,现编写成书,书中确有创新的观点,并敢于向传统的观念提出挑战。作者又从自己专业的角度出发,编写了自己在临床实践中所见的多发病与常见病的病例分析,比较具体详细,相信能对热爱生活、关注健康的人群具有启迪和借鉴作用。
热门推荐
  • 旋风少女:情之凝

    旋风少女:情之凝

    戚百草不想再用元武道伤害他人了,选择和若白的妹妹若雨离开,来到韩国,来到咏竹道馆,同时认识了李恩秀的妹妹李恩允。不久后,岸阳训练营再度开启,面对那么久不见的伙伴,还有刘清清的死缠烂打,若雨身世扑朔,迎风何时明白彼此的真爱?廷皓如何理解恩秀的一片痴心?白兔能否长久?婷宜能否放下心中的执念?胜浩何时放下恩秀去关注敏珠的存在?司徒御何时明白爱的真谛?还有更多更多的人——尹秀和长安,周星芸和水沉舟,尹哲尹纯,还有……最终的大boss……感情,到底何去何从?
  • 鬼环舞

    鬼环舞

    迷恋上古神兵的嬴钱从小便梦想着有朝一日能够打造出一把传说中类似于干将莫邪的神兵。于是,从二十岁开始,嬴钱便迷上了寻找天外陨石,他梦想着有着一日能够像干将莫邪一般用天外的陨石造出一把神兵。结果,一次意外让他来到了四千余年后的星元时代。面对星元时代用天外陨石制成的星环,他又将如何生存?继续他的神兵之梦?还是开始新的梦想?
  • 洪荒纪年

    洪荒纪年

    时值魔兽横行,门派纷争,乱世之年代,北有灵虚香一派,南有大迦叶法室一门,东有妙溪一宗,西则是那凌云一殿,各门派本不相往来,却因那兴起的邪教让四派惶恐不已,主人公出生在这个混乱的年代,一次偶然,被那第一神兵,太阿残片所刺入,从此开始了他不平凡的旅程。
  • 天行

    天行

    号称“北辰骑神”的天才玩家以自创的“牧马冲锋流”战术击败了国服第一弓手北冥雪,被誉为天纵战榜第一骑士的他,却受到小人排挤,最终离开了效力已久的银狐俱乐部。是沉沦,还是再次崛起?恰逢其时,月恒集团第四款游戏“天行”正式上线,虚拟世界再起风云!
  • 愿你抬头所见都是柔情

    愿你抬头所见都是柔情

    人的一生会有多长?十四岁遇见你,十五岁喜欢你,十六岁爱上你,在最难忘的年纪遇到了一个最难忘的人。星星是银河递给月亮的情书,而你是世界赠与我的礼物。青春那么短,还不够去爱你,多想回到那一天,笑着对你说:“你好,我的胡萝卜先生,初次见面,还请多多关照!”时间会是我们最好的情书,这本回忆录记录我们的成长和点点滴滴,写给你和我,也写给那些少年时勇敢爱过的人。
  • 洪荒之我是天地之主

    洪荒之我是天地之主

    我穿越到西游世界,成为一个成为魔族,一个普通的婴儿,然后我成为天地之主,比鸿钧更为可怕的存在。
  • 查理九世之千年绝恋

    查理九世之千年绝恋

    一对豪门出生的兄妹,失去了父母、爷爷奶奶,才三岁的哥哥带着刚出生的妹妹,开始接手自家所有的政务。哥哥12岁那年,患上了绝症。在妹妹的鼓舞下,活到了现在。但是,你真的认为他还会存活吗?一切不得而知。[按《查理九世》改编]
  • 无上仙缘

    无上仙缘

    无法无天踏九霄,上得青天白云间。仙法无穷妙无尽,缘至于此迹难寻。我欲踏凌云九霄,谁阻我无上仙缘!(本书不定时更新,纯粹的填坑之作。)
  • 招惹

    招惹

    复仇三观不正神挡杀神,佛挡杀佛对方生来说这一次她一定要活出真我
  • 安然明美

    安然明美

    人生若只如初见,是年何处寻芳踪。若有来生,请早些出现在我的生命里