因为发生了间谍窃密事件，艾玛干脆的将四种真菌交由起源生物科技研究所持续发展，药剂原型——恩赐真菌的样本和资料同样被彻底销毁，艾玛还出手清除了除玻利瓦尔外其他所有研究人员的相关记忆，原特拉斯克也并入了起源生物科技研究所，玻利瓦尔的股份折算成了现金，拿到了手里。
也是在这一年，赫默特庄园地下三百米处的实验室也在潘安的督促下日夜赶工，甚至高薪聘请了数名具有搬运土石能力的变种人参与挖掘，终于得以在冬天的时候顺利完工。
这座新实验室被交由玻利瓦尔负责，同样命名为特拉斯克实验室，只不过所有权完全是潘安夫妻三人的。为了让玻利瓦尔安心工作，潘安干脆的买下了一家为起源集团长期提供化学原料的大型企业，并且将这企业绝大多数的股份转赠予还在上大学的玻利瓦尔的儿子，他的女儿也同样被赞助进入了一所知名艺术院校，学习的一切费用都有起源集团负担，同时还被赠予了天价的定制加强版自愈型转生药剂，成为了3级变种人。玻利瓦尔的家也搬到了紧挨着赫默特庄园的别墅里，别墅同样是潘安夫妇赠予的。
这样种种的作为让玻利瓦尔感动万分，而且他在原来的实验室中由于有正负的部分介入，还有法律上道德上的约束，让玻利瓦尔感受到了种种的限制，无法尽情的深入研究，在潘安拍胸脯保证，又利用金钱买通了一些私人监狱的所有者，通过他们伪造疾病和事故死亡记录，来提供一批身体健壮但是罪大恶极的重刑犯，供玻利瓦尔做一些禁忌性的试验。就连他的研究助手也同样是来自监狱，都是一些高智商罪犯，在经由艾玛深度洗脑之后，吃穿住行都在实验室里，终身不会离开实验室一步。
潘安将之前所有秘密收集到的资料、样本、实验素材、实验器具都交由玻利瓦尔任意使用，包括天启、阳炎和生命碑的残骸。同时在金钱使用方面给了他极高的自由度，让他尽情的挥霍自己的才能。
时光如梭，眨眼间过去了整整二十年，到了2006年。在这些年里北方红色联盟还是没能逃脱它原本的命运，在2002年的春季正式解体，北方红色联盟自从成功窃取转生药剂的全套资料后，就开始将资金大笔投入进行生产研究，而被惹恼了的美国联合北约极大的收紧了与Hua约集团的贸易往来，Hua约集团贫弱的民生经济在军事优先的正册下越发的低迷。而随着由起源集团带动的，对变种人异能的各种研究接连突破，美国又一次引领了科技革命，而这一次是以核能应用小型化为代表的能源革命。
通过对变种人异能的研究，科学家研发出了一种新材料，可以极大地提高热能利用率，能够将热量快速的大比例转化为电能。而另一项成果就是能够在超高温高压环境下运行的磁场约束发生器，两相结合再加上一些其他技术，可以超长时间不间断提供庞大电力的高能核能电池就此诞生。有了超高电量储存能力的超大功率核燃料电池，纯机器人战士就不再是梦幻。而且由于核燃料电池具有危险性，一旦受到损害就有可能造成核泄露，所以这项技术最多的应用于无人机械部队，由士兵进行远程操控作战。
大批被命名为“哨兵”（潘安的恶趣味）的机器人战士被投入了前线，给Hua约集团造成了极大的压力。为了对抗哨兵机器人，北方红色联盟不得不再次加大军事投入，本就不多的用于发展民生的资金再次被占用，而且Hua约的市场本来就不大，军用技术转化为民用产生的效益，对于高涨至天上的军事开支来说也是杯水车薪。终于在一场又一场因为民生严重不足而造成的内部纷乱之中，Hua约集团走向了它的末路。
而北约集团其实日子也不好过，美国的军事开销也是天价，为了给北方红色联盟制造足够的压力，甚至草率的就将还不成熟的技术应用于机器人，然后大量生产，造成军队的维护保养费用水涨船高，达到了已经无法承受的地步，只不过北约整体的民生经济毕竟要比Hua约集团好上不少，这才得以将北方红色联盟活活耗死。
而美国因为军事投入太大，严重挤压了民生经济投入，造成了失业率高企，通货膨胀严重，大批的民众不断地走上街头抗议，使得美国社会持续混乱，只不过还好北方红色联盟先行倒下了，给了美国正负舔舐伤口的时间和机会，得以重新平衡国内经济的发展。
在这二十年当中，X战队也被迫不断的走上战场，与北方红色联盟的高阶变种人部队战斗与厮杀，双方损失惨重，甚至在一场埋伏战中伤亡过半，不得不装备大量的哨兵机器人用做炮灰，埃里克因为熟识的战友不断阵亡，有些心灰意冷，干脆的放弃了晋升的机会退役回家。接替他队长位置的是凤凰女琴，副队长为风暴女，她们在一轮轮的战斗中快速成长，而跟随埃里克一起退役的灵蝶则成为了磁石佣兵团的团长。
退役后的埃里克和同样退休下来的查尔斯一起在X学院教起了书，悠闲的过着普通教书匠的生活，X学院的院长则由天使沃伦接任，副院长则是红女巫旺达。在这些年中X学院已经成长为世界上最著名的变种人教育学院，同时也是研究变种人的前沿场所之一。
而起源集团与X学院牵头针对变种人起源的漫长研究也终于在千禧年初期有了成果，以X基因（查尔斯坚持命名）为标志的一系列成果公布于众，引起了轰动，特别是X学院校长查尔斯这一变种人领域的权威研究专家，所提出的变种人非自然产生的论述引起了全部人类社会的轩然大波。当然潘安哪怕在前世不是X战警迷，仗着看过一些漫威动漫还是知道内情的，变种人就是远古时期外星高等文明的造物——天神组在地球进行实验的实验品。
变种人甚至是全人类其实都是外星人的试验造物，在经过查尔斯教授常年的研究后，发现全人类的基因片段里都包含有X基因，只是每个人所拥有的X基因片段都不完整。这种基因是一种非常奇特的基因组，在电子显微镜下可以在构成这一基因片段的脱氧核苷酸分子上发现细微的不同，构成脱氧核苷酸分子的碱基除了原先的四种之外，竟然还发现了另外十二种。
