克洛伊试图接触人类的信息，不想被视为入侵，所以克洛伊认为“种子”已经叛乱，决定与“种子”强行接触，打开他们的中枢信息传播途径。然而联军誓死抵抗，放出“联军与首都共存亡”的口号使这一计划破灭。所以克洛伊擅自做出主张，展开“清除计划”。
联军集结60万军队与克洛伊“的先驱者”在秦岛展开第一次正面对决，人类打算使用大军团作战方式企图用人数压倒外种族攻击。联军中国集团在蒹葭关遇到“先驱者”先前军队，打响了人类反抗外种族的第一枪。
然而只是先头部队已经把联军打的溃不成军。开战后一周损失过半，克洛伊使用大规模杀伤武器（后查实为基因武器人类称之为生化武器）人类根本无法抵抗。克洛伊统领“先驱者”所到之地，横尸遍野，直指华夏首都—帝都。半月后帝都失守。这就意味着通向各地的交通网门户大开，克洛伊下令建造多个传送门，准备全球大战。
2132年10月4日，传送门进行第一次传送。
2132年10月27日华夏沦陷。
2132年11月7日纽斯顿发出战略防御号令，誓死守护联军总部。
2132年12月18日，亚洲，非洲，欧洲大部沦陷。
2132年12月21日联军决定建立A小队，进行刺杀行动，目标克洛伊，代号“鲸落”（“足以载入史册的刺杀行动”克洛伊在自己的回忆缓冲里记录道）
2134年1月27日由于A小队全军覆没，克洛伊发起战略总攻，目标?纽斯顿。
2135年8月1日纽斯顿沦陷。
2135年10月1日克洛伊侵入人类基因，唤醒“种子”记忆。
