康熙三年（一六六四、甲申）春五月初八日（辛未），四川总督李国英疏报巫山巨寇郝摇旗下伪总兵马进玉等率众投诚。下部察叙。
十三日（丙子），升随往福建右路总兵官王进功为福建提督。
管理福建安辑投诚事务户部郎中贲岱疏报，郑芝豹生母黄氏率子侄眷属等赴闽投诚。下部察叙。
二十一日（甲申），四川总督李国英疏报：『蜀中巨寇刘二虎、郝摇旗、袁宗第抗抚负固，狡谋不测；蒙遣西安将军传喀禅、副都统杜敏统领大兵，会同督提进剿。于康熙二年十二月二十三日师次陈家坡，逼近贼巢：满、汉兵奋勇剿杀，贼遁入天池寨。副都统杜敏等统兵追剿，刘二虎势穷自缢，郝摇旗、袁宗第夜遁。杜敏等复追至黄草坪，大败贼众，擒郝摇旗、袁宗第并伪王朱宗蒗等；数万巨寇一朝扫平，无一漏网』。得旨嘉奖，下部察叙。
二十三日（丙戌），福建总督李率泰疏言：『原任提督侯马得功妻刘氏、子马三奇呈称马得功统领水陆官兵攻取厦门、金门二岛，力战身死；请赐恩恤，以慰忠魂』。得旨：『马得功舍身死战，堕水殒生，着从优议恤』。
二十六日（已丑），授福建投诚伪伯陈辉为慕仁伯。
二月初五日（戊戌），授福建投诚伪官伍浚益、洪征、董时行、洪弼都督佥事衔。
初十日（癸卯），靖南王耿继茂等疏报：『福宁总兵官吴万福招抚伪镇林国梁投诚，随遣游击李应先等协同攻克长腰、东蚶二岛；寇巢破灭，伪兵部阮春雷、逆渠张煌言仅以身免。请敕议叙』。得旨：『据奏逆贼阮春雷、张煌言等窃踞东蚶、长腰等岛合〈舟宗〉狂逞，官兵奋勇夹剿，擒斩贼将、夺获船只、焚毁贼巢，深可嘉尚！在事有动人员，察明议叙。其伪镇林国梁带领家口倾心投诚，复奋勇自效；同官兵捣巢穴，克奏捷功，非寻常投诚可比。着从优议叙』。
十四日（丁未），兵部议覆：『平南王尚可喜疏言铜山诸逆郑锦、周全赋等各思归诚，请以招抚事宜专责饶平总兵官吴六奇相机料理；应如所请』。从之。
十五日（戊申），管理广东安辑投诚事务刑部郎中花善等疏报：『伪都督杜辉于康熙二年十一月率所属将领一百二员、水陆兵丁二千九十六名、大小战船六十二只，缴伪印关防牌札献南澳地。又伪总兵吴升率所辖伪官三十三员、兵六百九十三名、大小船十一只缴伪观武将军印，并倾心役诚』。下部知之。
二十一日（甲寅），福建总督李率泰疏报宁化县山寇聚党八百余人劫掠地方，总兵官黄大用调兵进剿，执斩贼首钱禾，余党悉平。下部知之。
二十六日（已未），湖广总督张长庚疏报西山巨逆马腾云、党守素、塔天宝等率众归诚。下部知之。
三月癸亥朔，加授福建福宁总兵官吴万福都督同知，以叙攻剿海寇阮春雷等有功也。
初四日（丙寅），靖南王耿继茂疏报：『海逆洪旭、黄廷等拥郑锦残党遁踞铜山，所辖伪将张杰、吴盛等率领兵民渡海投诚。群贼分〈舟宗〉来追，意欲乘机入犯内地。总兵官王进功统兵驰剿，歼贼众于陆鳌、破贼巢于下蔡；番斩首千余级，按应投诚人等入界。在事有功镇将及张杰、吴盛等，均请叙录，以励将来』。下部察叙。
初七日（己巳），授广东投诚伪官杜辉、吴升左都督衔，杜腾、郭惠都督同知衔，吴鹏都督佥事衔。
夏四月初二日（甲午），管理福建安辑投诚事务郎中贲岱疏报伪左都督陈升率大小文武官一百二十三员、兵丁二千六百余人渡海投诚，请隶海澄公标下效力。下部察叙。
初七日（己亥），福建总督李率泰报：『伪左镇林国梁率众投诚，所有伪札关防已移送安辑部臣恭缴；应邀恩优叙，以示鼓励』。得旨嘉奖，下部察叙。
二十一日（癸丑），兵部议叙伪忠明伯周全斌率左右都督以下杨泮等投诚功；得旨：『周全斌授为三等伯，杨泮、周珍、曾传、黄宝、林英授左都督职街，张隆、阮星、欧瑞、陈麟、赖工、张岳授右都督职衔』。
二十九日（辛酉），升靖南王右翼镇副将马化麒为随征福建右路总兵官、右路镇标副将刘进忠为随征福建中路总兵官。
－－以上见「大清圣祖仁皇帝实录」卷十一。
五月初五日（丙寅），靖南王耿继茂疏报：『三月初六日，臣与总督李率泰、提督王进功、海澄公黄梧等领兵先后至八尺门；伪威远将军翁求多率兵民六万余人纳款。十四日夜半渡海，进拔铜山，焚毁贼巢，斩首三千二百余级；伪永安侯黄廷、伪都督余宽等率伪官兵并家属人等三万二千四百余名出降，所获船只、盔甲、器械无算。逆渠郑锦仅存数十艘，扫灭殆尽』。得旨嘉奖，下部察叙。
初九日（庚午），吏部议覆：『兵部左侍郎石图疏言：「闽海投诚伪武职官内有人品单弱、熟晓文义者，请酌改文职官」；查无旧例，不准行』。得旨：『投诚官内有通晓文义、愿以文职效用者，该地方督、抚察明具题酌用』。
二十二日（癸未），授福建投诚周全斌为承恩伯，食三等伯俸。
二十四日（乙酉），叙铜山投诚功，以何政、许正、李思忠为左都督，叶志凤等为都督佥事；余授职有差。
六月初六日（丁酉），福建总督李率泰以病求罢。得旨：『览奏患病是实，本当即允所请。但闽省投诚兵民官员最为繁众，着亲行安插，务使得所。事竣之日，解任回京。应作何加级加恩？该部一并议奏』。
十五日（丙午），以福建投诚伪官杨富为四川川北总兵官。
十九日（庚戌），授福建投诚伪侯黄侯为慕义伯。
闰六月初二日（壬戌），命都督佥事事施福随水师提督施琅标下效用。
福建总督李率泰疏报总兵官李长荣等出洋会剿逆寇张煌言，击败贼众五千余人；又擒伪总兵张贤等，并获船只器械。下部察叙。
福建水师提督施琅告请终养；慰留之。
初三日（癸亥），颁赐荷兰国王缎疋银两，以二年冬助兵剿海逆有功也。
初六日（丙寅），浙江总督赵廷臣题报伪将军郑殷就抚。下部知之。
初十日（庚午），以福建投诚伪官郭义为郧阳总兵官。
十八日（戊寅），改南澳投诚官杜辉为广东右路水师总兵官。
秋七月初五日（甲午），管理福建安辑投诚事务户部郎中贲岱疏报：『自康熙元年至三年止，合计投诚文武官三千九百八十五员、食粮兵四万九百六十二名、归农官弁兵民六万四千二百三十名口、眷属人役六万三千余口、大小船九百余只』。下部知之。
十八日（丁未），敕福建提督水师总兵官施琅等曰：『海寇虽已荡平，逆贼郑锦尚窜台湾。率以尔施琅素谙海务、矢志立功，特命尔为靖海将军，以承恩伯周全斌、太子少师左都督杨富为副，以左都督林顺、何义等为佐，统领水师，前往征剿。凡事，会议酌行。毋谓自知，罔听众言；毋谓兵强，轻视寇盗。严设侦探，毋致疏虞。抗拒不顺者，戮之；大兵一至、实时迎降者，免死。有能擒杀贼渠投诚者，核明具奏。行间将领功罪，察记汇奏。务期殄灭逆孽，副朕倚任之意。尔等受兹重任，宜殚竭心力，以奏肤功。钦哉！特谕』。
－－以上见「大清圣祖仁皇帝实录」卷十二。
八月初九日（戊辰），浙江总督赵廷臣疏报随征总兵官范达礼招抚伪兵部侍郎蔡昌登等缴伪敕印投诚，请给衔俸；以劝来者。下部议。
十五日（甲戌），浙江总督赵廷臣疏报：『逆渠张煌言盘踞浙海多年，其下伪官节次招降，独张煌言抗不就抚。臣与京口将军刘之源先后发书遣使谕以祸福，劝其去逆效顺；张煌言之死不悔，虽将随从兵弁船只起发进关，犹借名归隐，徜徉海外。臣即驰赴定海，会商水陆提督哈尔库、张杰分遣将士配坐船只，由宁、台、温三路出洋搜剿，毁其贼巢、歼其余党。侦知张煌言披缁远遁，密令骁勇将备徐元、张公午扮成僧民，随带健丁、火器潜伏普陀山一带，仍拨将弁扼守要路，以防奔窜。至七月二十日，瞭望朱家尖有赶缯船一只，急举火器前击，获有活口林生、陈满等，知张煌言见在悬山范澳；徐元等即驾所获贼艘，尾随八桨兵船，令活口林生等仍扮差回原船，使之不疑。乘夜进一小港，从山后觅路，突入账房；遂擒张煌言及其亲信余党，搜出伪「视师兵部」银方印一颗、伪关防九颗、枪炮盔甲旗伞等物。三省出没之渠逆，一旦生擒；凡经过宁、绍、杭各府，百姓聚观如堵。从此奸宄绝迹，海宇肃清，共仰天威震迭矣』。得旨嘉奖，下部议叙。
二十日（己卯），湖广总督张长庚疏报：『靖西将军都统穆里玛、定西将军都统图海等率旅与三省缘旗兵合剿西山巨逆郝摇旗、刘汝魁等业经授首，独李来亨拥众茅麓山，最为险峻；官兵昼夜环攻，贼势穷迫，其党陆续下寨归降。八月初五日，李来亨全家自缢，举火焚巢；官兵搜剿余党，楚寇荡平，全师奏凯』。下部察叙。
九月十八日（丙午），广东总督卢崇峻疏报：『平南王将军、提督等统领官兵于八月十二日进剿碣石卫贼巢，擒斩贼首苏利，俘获余党万余，贼寨荡平』。得旨嘉奖，下部察叙。
二十日（戊申），福建总督李率泰疏言官兵会剿茶仔畬山寇，生擒贼首余角，余党俘斩无算，各峒寨悉平。下部察叙。
冬十月初三日（辛酉），福建水师提督施琅疏报郑逆商人蓝英带货物投诚。下部知之。
初八日（丙寅），靖南王耿继茂疏报：『荷兰国出海王于八月十六日带领番船十只、番兵千人抵闽安镇，约九月二十日至围头取齐，于十月初旬往澎湖攻贼巢，候风便进取台湾』。下部知之。
初十日（戊辰），海逆张煌言伏诛。
十六日（甲戌），拨投诚兵二千名隶海澄公黄梧下，合旧兵三千名。立中、左、右、前、后五营。
二十二日（庚辰），福建总督李率泰疏报总兵官马化麒于古雷山遇贼船三十一只，奋勇力战，阵斩一百七十余人，擒获一十三人；得获器械、船只，因无水手撑驾，实时焚毁；兼报炮伤官马三匹。得旨：『斩杀贼伙，得获器械，因无撑船之人焚毁等语；系从何来之贼？其贼首为谁？且近地所得船只，焚毁是何缘故？既云官马三匹被炮倒毙，其战士何以无一被伤者？其中或边地官员欲行邀功，杀投来之人谎报亦未可知！着该督严行察明具奏』十一月戊子朔，以投诚左都督杨来嘉为湖广襄阳总兵官、投诚左都督三等阿思哈番蔡缘为河南河北总兵官。
初七日（甲午），镇守福宁总兵官吴万福疏报：『叛镇苏利贼党密遣贼艘从外洋潜入闽地，官兵哨探堵截，斩获贼众、焚夺贼船，片帆不返』。下部知之。
十二月十二日（己巳），升副将刘炎为福建汀州总兵官。
－－以上见「大清圣祖仁皇帝宝录」卷十三。
