对于卡斯特罗有恃无恐的态度美国已经忍无可忍，1960年6月22日，美国通过法案削减了对古巴的食糖定额，希望通过加大经济制裁力度的方式来逼迫卡斯特罗妥协。然而，卡斯特罗的反应与美国的期望大相径庭，他宣布美国每削减一次食糖定额，古巴政府就没收一家美国糖厂。一场经济战拉开了帷幕。7月，美国再次发出削减通告，将定额减去70万吨。卡斯特罗也不甘示弱，他准备全民武装，用军事来对抗制裁。美国这次的削减有些太霸道了，完全是赤裸裸的经济侵略，很多国家对美国的做法都颇有微词，特别是美国的死对头苏联更是公开表示，必要时可以用火箭来保护古巴。
美国不肯退让，在参加美洲国家外长特别会议的时候，美国外长赫脱还在苦口婆心劝说与会外长们能够同意一起谴责古巴。那些外长们大部分拒绝了赫脱的要求，他们知道卡斯特罗在各个国家都有崇拜者，得罪了他就等于得罪了自己国家的人民。
1960年9月，卡斯特罗公开宣布要接受苏联提供的火箭，用来对付美国的侵略。这番演说得到了古巴人民的普遍的赞同。美国愈发气愤了，1960年是美国总统的大选年，对古巴问题的处理成为竞选者能否得到更多选票的关键。
美国越是生气就越是能激发起卡斯特罗的斗志，他喜欢跟美国作对，喜欢看到美国总统那副气急败坏的样子。于是，卡斯特罗在古巴陷入经济危机的时候依旧向美国应战。1961年4月16日，卡斯特罗宣布，古巴正式成为社会主义国家。这个宣言带着浓重的挑衅滋味，美国反对什么就偏要做什么。就像卡斯特罗在宣言中表示的那样，就是要在美国的鼻子底下来一场社会主义革命。
1961年4月17日，美国终于按捺不住，决定实行武装行动了，并发动了那场让美国人羞愧至今的战役——猪湾登陆。
对此，卡斯特罗早有防备，从宣布成为社会主义国家的那一刻起，他就做好了打这一仗的准备。所以，当美国轰炸机袭击古巴几个重要机场的时候，卡斯特罗并没有慌张。他立即下令追查一些地下组织，并抓捕了不少反对派，这就减少了美国利用这些人来做内应的可能。
美国似乎忘了它所对付的是一个怎样的政府，组成这个政府的人员都是在猪湾登陆不仅使美国蒙羞至今，更从此多了一个坚定的敌人。
游击战中有过突出表现的，比如格瓦拉，时刻准备战斗是他们的习惯。因此，猪湾登陆最后以古巴的胜利而告终，参加此次战役的1000多名美国雇佣军悉数变成了俘虏。美国栽了个大跟头。
五“卡斯特罗是最重要的”
虽然猪湾登陆行动以古巴的胜利而收场，但通过这一事件，卡斯特罗也意识到美国的军事干涉将是他今后面临的最大威胁，对此，他绝不能掉以轻心。
于是，卡斯特罗决定向苏联寻求军事援助。
其实，此时的苏联人也密切关注着猪湾事件的进展。当时，苏联与美国争霸正酣，赫鲁晓夫一直想在拉丁美洲寻找一个立足点，而古巴的求援，正是他求之不得的事情，于是，在1962年的7月3日和8日，赫鲁晓夫先后两次与卡斯特罗会谈，并达成了一项秘密协议。
按照协议，苏联将于7月开始向古巴提供几十枚携带核弹头的中程导弹、几十架伊尔—28喷气式轰炸机以及3500名军事技术人员。经过伪装的第一批武器于7月下旬用商船运抵古巴，并展开了部署，9月初，所有武器和专家已运送完毕，部署工作接近尾声。
美国是在10月发现苏联设在古巴的导弹发射场的。10月14日，根据两架U2高空侦察机在古巴上空拍摄到的照片，美国鉴定专家认出了一个导弹发射台和一枚中程导弹，并确信导弹发射装置上安装的是导弹核武器。
约翰·肯尼迪得知这一消息后大为震怒，10月22日晚上7点，他在电台里向美国和全世界发表讲话，通告了苏联在古巴部署核导弹的事实，并宣布从即日起对古巴进行武装封锁，直到苏联从古巴撤走这些进攻性武器为止。
史上着名的“古巴导弹危机”事件由是爆发。
封锁命令一下达，美国三军部队立即剑拔弩张，开始进行战时集中。10月24日，在68个空军中队和8艘航空母舰护卫下，由90艘军舰组成的美国庞大舰队浩浩荡荡开往古巴海域。上午10时，海上隔离行动正式开始，只见在蓝色的加勒比海上，美国海军舰只一字排开，将整个古巴像个铁桶似的团团围了起来。
苏联所以向古巴提供导弹，其实并不是真的支持古巴用导弹来对付美国，而是希望通过这种威胁对美国造成压力，以逼迫美国在柏林问题上做出让步。
因此，在古巴导弹危机发生后，苏美双方立刻展开了紧急斡旋。针对赫鲁晓夫的讨价还价，肯尼迪坚持在柏林问题上美国不会做出任何妥协，但他做出让步说，只要苏联拆除安装在古巴的导弹，美国就保证不攻打古巴。否则，美军将会在10月30日开始轰炸苏联在古巴的导弹设备和古巴的军事目标，然后全面侵入古巴。
面对美国的武力威胁，卡斯特罗毫不畏惧，他号召全古巴人行动起来，做好迎击美国入侵者的准备。但苏联不想使事态扩大，赫鲁晓夫最终同意了美国的条件，答应拆除安装在古巴的导弹以换取美国不攻打古巴的承诺。到11月11日，苏联部署在古巴的42枚导弹被全部撤走，与此同时，肯尼迪宣布取消对古巴的海上封锁。至此，古巴导弹危机就这样结束了。
1967年，古巴又发生了一件令人难过的事情：着名革命英雄切·格瓦拉在玻利维亚革命战斗中遇害。切·格瓦拉是卡斯特罗的密友，也是他的得力助手，这位英雄的离开让卡斯特罗以及所有崇拜格瓦拉的人怅然若失。
格瓦拉不是个优秀的管理者，这点不需要掩饰。说实话，格瓦拉的性格并不适合当一个政治家，他太直率了。当初古巴跟苏联打成一片的时候，格瓦拉就毫不掩饰自己对苏联共产党的厌恶，他认为苏共正在偏离社会主义的本质。
卡斯特罗后来也不得不承认，格瓦拉的看法是正确的。当格瓦拉遇难后，卡斯特罗曾说：“对于一个人来说，有些人并没有死。他们是那么牢固、那么强大、那么强烈的存在，以致人们不能相信他们已经死去，已经消失。主要是因为他们继续存在于感情和记忆中，我们，不仅是我，而且是古巴人民，对他死亡的消息特别悲痛，虽然消息并不意外。”
20世纪60年代对于古巴来说真是多灾多难，内政伴随着战争一拥而入，让卡斯特罗费尽脑筋。当卡斯特罗最需要人帮助的时候，格瓦拉又离他而去。所幸的是，古巴人民没有抛弃卡斯特罗，并且一直信任他。
此后的古巴也不是一帆风顺，仍然是在摸索的道路上磕磕碰碰。一直到80年代，古巴经济都没有大的起色。卡斯特罗曾经用相对自由的市场经济政策来推动经济发展，可结果却导致了物价上涨，这个政策也草草终结。经济落后让古巴在很长一段时间内都恢复不了元气，没有水果、蔬菜，没有生活基本用品，没有石油。
这个时候，古巴国内外有一种声音要其改革，将社会主义改为资本主义。
可是卡斯特罗并不认为目前的困难是因为走社会主义道路而产生的，在他看来，无论是什么制度的国家都会遇到经济低迷的时候，这是一个国家必然要经历的过程。因此，要凭这个就进行资本主义改革，那绝对不可能。正是卡斯特罗执着或是说执拗的性格打动了古巴人，古巴人并没有因为经济问题而讨厌他，反而一如既往支持他。
古巴目前的状态正是美国以及在美国的古巴流亡分子所希望见到的，卡斯特罗过得越艰难对他们越有利。这些流亡分子开始趁机四处散布谣言，称卡斯特罗快要下台了。
卡斯特罗从来不担心流亡分子的挑衅。有些好心人提醒卡斯特罗，古巴经济停滞不前，美国又在大西洋和加勒比海进行军事演习，小心美国的入侵。在民族尊严问题上，卡斯特罗从不让步。他表示只要美国胆敢侵犯古巴，他就制造第二次越南战争让美国求生不得、求死不能。与此同时，卡斯特罗在积极预防美国入侵，加强国防安全任务，让所有可武装的军队都做好战争准备。
这场仗终究没有打起来，卡斯特罗再次让世人见识到了他的不屈不挠。有人觉得卡斯特罗能够长期执政简直就是一个奇迹，因为古巴国内的状态实在无法让人相信他能够扭转乾坤。如果真的这样想，那就大错特错了，古巴经济虽然萎靡不振，但并不意味着卡斯特罗一事无成。有些事实需要让人们知道：在卡斯特罗执政的日子里，古巴大学生、医生的数量超过了任何一个拉丁美洲国家；哈瓦那连个乞丐都看不到；婴儿死亡率从独裁者时期的6%降为0.7%。
这就是为什么古巴经济停滞可卡斯特罗却没有倒台的原因之一。
卡斯特罗没有倒台的另一个重要原因就是他给了古巴人他们所需要的关怀。
经历过独裁统治后，古巴人受够了独裁者通过压榨百姓来中饱私囊的做派。虽然卡斯特罗没有让古巴人脱贫致富，可起码他不会压榨百姓，而且他还一直在关心穷人。对于古巴人来说，推翻现任政府就等于推翻了自己的安全感，让那些流亡分子执政的结果不会比独裁者执政好到哪去。于是，大部分古巴人认为，古巴一些制度的确需要改革，但却不是走资本主义道路，更不是推翻卡斯特罗政府。
“我没想过剃胡子，我习惯留着胡子，我的胡子对我的国家来说意义非凡。当我们实现诺言，建立起一个好政府时，我会剃掉它。”这是卡斯特罗推翻巴蒂斯塔独裁政权第30天说的。如今已过去了50年，卡斯特罗的胡子已经银白但却始终没被他剃掉。显然，卡斯特罗并不认为自己为古巴人建立起了一个好政府，所以他一直在努力，从不曾停止革命的脚步。也许古巴是穷，但是却不影响古巴人对卡斯特罗的爱，正如一位古巴人在接受采访时所说：“对于古巴人，对于全世界古巴人，卡斯特罗是最重要的。”也许正因为如此，在那个嗜血的政途上，卡斯特罗一直安然无恙。
古巴导弹危机中，美国海军对进出古巴的每一艘货船都严加盘查。
