在一个喧嚣热闹的城市，一个名叫秦风的少年正摆弄他从小贩得来的新的神奇宝贝机。
那位叫秦风的少年站在树下搬弄他的爱物。这时，一道闪电将他击落在地，秦风眼前变出现另一种景象。
他的眼前出现了一个年迈的老人，对着秦风说：“对不起孩子，我是一名掌管时间的老人，不小心将你的时间调成了零。所以，我现在可以完成你三个愿望，你愿意吗？”秦风在老人的说话间回过了神，意识到自己已经死了说：“我想让我父母过上幸福的生活，我想要一个系统，我想去神奇宝贝世界里成为小智，大部分就是这样了。”
“嗯好。我现在就送你去你想去的世界。”老人边说边施展着法力。接着，一道光包围着秦风传送了出去。
以上都市生活已结束，接下来进入神奇宝贝世界。
“小智，起床了。”一个叫花子的女人正咆哮着。这时，魂穿后的秦风正躺在原主人小智的床上惊喜地蹦跳着，一声恶龙咆哮打乱了秦风的思路。秦风急忙的下楼，边说边跑：“妈，叫我什么事”“儿子，我给你报了大木博士的训练营，你到了十岁就去吧。”秦风心想：这时小智还没有参加应该是七八岁吧。
正当秦风思考的时候脑里传来机械的声音。“叮，智神系统一激活。”
“叮，正在开机1%，2%……45%，65%，85%，100%”
“叮，正在核实宿主身份：小智(秦风)(穿越者)”
“叮，正在发送新手礼包”“叮，新手礼包已到，请宿主查收。”
秦风一听十分激动，因为前世他也是一个小说迷知道礼包开启流程，他用意念点开了礼包。
“叮，宿主运气爆棚开到，极品搜查术和波导之力，一个神级宝箱，进化石一套(已放在系统空间)”
“叮，宿主是否开启宝箱。”
秦风意念将宝箱打开，“叮，宿主获得原主人的宠物皮卡丘，再配赠一个电气珠(已在系统空间，请宿主查收)。”
“叮，宿主触发临时任务：在训练营开始之前，在大木研究所学习。可奖励一只利欧路。”
当秦风将系统的消息看完回过神发现花子正看着他，连忙说：“我有点吃惊。对了，妈。我想到大木研究所学习到训练营开始，可以吗？”“当然可以，我先去给博士说一声。”花子说。
吃完晚饭，秦风来到一片空地，放出了皮卡丘。挨近它说：“皮卡丘，我是你的训练师小智，请多指教。”“皮卡，皮卡，皮卡丘(你好小智)。”皮卡丘叫到。
回到家，秦风躺在床上回想起自己的父母，不禁潸然泪下。接着在皮卡丘的搽泪下，入睡了。
接着，在大木研究所的学习下，秦风学习了很多知识，并完成了任务。得到了利欧路和十个豪华球。
接下来，就请你们继续看下一章：大木训练营，初遇飞天螳螂。大家一起来收服宝可梦吧。
