登陆注册
55669400000014

第14章 2.7kb基因片段缺失

秦兰点了点头:“这样,这组实验算是比较严密了。”

梁晓慧滔滔不绝的继续:“四个样本全部用的NGS,二代高通量测序,所有的基因数据也都分析了一下,因为是同一个人的DNA数据,软件跑起来非常的快,甚至,生成了VCF格式的基因数据文件后,我还自己还做了一个小程序验证了一遍。”

程峰一脸懵逼,连连说道:“那个,能不能说我听得懂得东西,直接说结果好不好!给领导汇报工作,要简洁,明了!”

“额,这样还不够简洁吗?那好吧,软件方面的事情我就不说了。”梁晓慧又推了推眼镜,似乎是瞪了程峰一眼.

乔飞低头向程峰解释道:“别急,实验就是这样的,必须先了解整个实验构架,才能知道结果能否准确表达实验目的。”

秦兰继续向程峰说道:“之所以要用生物信息学的软件分析,是因为人的基因组数据非常庞大,如果用一个字符表示一个核苷酸分子,那么一个人的全部基因数据就会有大概3个G。

而且在测序的过程中,考虑到测序仪会出现个别点位的误差,所以,常规的全基因组测序会测30重,也就是把一个样本测30遍,以此来增加准确度,这样,数据就会有90个G了,如果用人眼看,一秒钟看一个字符,看完所有的数据需要3000多年,所以必须依赖计算机。”

“好吧!好吧!你们都是道理,我听你们的。”程峰懒洋洋的说道。

梁晓慧得意的笑了笑,似乎是在挑衅程峰,说道:“那我们先说说白化病吧,白化病分为综合征白化病和非综合征白化病,综合征白化病不用管,174患的是非综合征白化病中的眼皮肤白化病,一共四种类型,分别是OCA1——4。

顿了一顿,梁晓慧继续:“174所患的是其中的OCA2,这个类型的眼皮肤白化病的致病基因是位于15q11.2——q12的P基因,因为遗传缺失了长度为2.7kb的DNA片段,1号和2号样本同时反映了这一点。”

秦兰看向乔飞:“这个结果你应该自己也做过,对吗?”

乔飞回答:“是的,我自己测过自己的DNA,知道我是OCA2型白化病,这个P基因一共包括了80多种SNP的单核苷酸多态性突变和80多种病理性变异,我是其中最常见的2.7kb缺失,因为这段DNA的缺失,导致我体内的酪氨酸酶活性完全丧失,没有合成黑色素的能力。”

“说重点,3号和4号样本呢?”程峰好像听明白了一点,问道。

梁晓慧看了看程峰,投去一个不忿的眼神:“3号和4号样本反应出来结果…总体上是一致的,首先,已经足够证明174的身份,在昨天的会议之前,我们就把这个结果先上报了。”

“哦,是这样,怪不得侯局长说DNA的检验结果,已经足以证明我是乔飞了。”乔飞说道。

梁晓慧习惯性的推了推眼镜:“重点是,那个2.7kb的DNA片段,在3号和4号样本上同时出现了。”

这个2.7片段的DNA缺陷,出现了!

毕竟,乔飞的白化病已经好了,大家或多或少的已经知道了这个结果,但是,在所有人的脸上,还是满脸的震惊,当然,除了程峰。

白化病的致病P基因,缺失的2.7kb的DNA片段,在乔飞细胞中,修复了。

这,又回到了那个老问题,怎么做到的?如果是在体外,用最新的DNA编辑,是可能实现单细胞DNA修复的,然而,对于在乔飞体内,这毫无疑问,是不可能做到的!

科技水平达不到!

所有人都在思考,房间静的针掉可闻……

“那个…”梁晓慧似乎不太满意房间的气氛,继续说道:“我还没说完,还有新的发现呢。”

还有新的发现?!乔飞和秦兰同时愣了一下。

按理说,这个实验结果,已经足够说明问题了,怎么还会有新的发现?

看到所有人都在注视自己,梁晓慧这才深深的吸了一口气,继续说道:“如果不是我和测序组的同事学仪器操作,手贱又拿3号和4号样本做了一次单分子测序,我根本发现不了。”

“又做了一遍单分子测序吗?然后呢?”乔飞似乎想到了梁晓慧想要说什么,瞬间呼吸加重了。

梁晓慧得意的推了推眼镜:“3号和4号样本的单分子测序,结果发现4号样本的第二次检测结果,同1号和2号样本一样,缺失那2.7kb的DNA。”

秦兰瞬间想到了关键点,失声问道:“你有没有继续增加单分子测序次数?”

“当然有!”梁晓慧说道:“我这么聪明,怎么会想不到这个问题,就马上联系测序组的同事,要求增加3号样本和4号样本的单分子纳米孔测序次数,3号和4号各测了一百遍,熬了我两天一夜。”

“结果显示…3号样本,76次具有2.7kb,24次缺失,4号样本,83次具有2.7kb,17次缺失。”

整个房间又一次寂静下来了,几秒钟后,程峰忍不住问道:“这一会有一会没有的,说明了什么?什么意思,你们快把我弄疯了。”

没有人回答他,所有人都在思考。

直到半分钟之后,秦兰才深深的吸了一口气,解释道:“假设乔飞的身体,缺失2.7kbDNA的白化病细胞和具有2.7kbDNA的健康细胞同时存在,那么,用NGS二代高通量测序,两种细胞的DNA全部被提取出来,经过PCR后进行测序,缺失DNA的那部分白化病细胞的检测结果,被掩盖了。”

看到程峰仍然是一脸懵逼的样子,乔飞举了个例子:“NGS高通量测序,就像光照双层不透光黑纸的试验,一层是好的,另一层破了一个洞,即使另一层破了个洞,你的光照实验,也只能是阳性,因为,只要一层黑纸,就能挡住光线了。光照试验发现不了其实有一张黑纸是有洞的。那个洞,就是我缺失的2.7kb的白化病致病DNA片段。”

顿了一顿,乔飞继续说:

“而单分子纳米孔测序技术,是最新的第三代测序技术,原理是将DNA分子经过处理后通过一个纳米孔,纳米孔有正负电极,不同的核苷酸带的电荷是不一样的,所以,每个核苷酸通过纳米孔后,得到的电信号不一样,这样就可以测定DNA了。因为不用PCR,所以理论上,单个细胞就能测出一个人的全部基因数据。”

同类推荐
  • 淘沙诀

    淘沙诀

    五十年前,长江淘沙人李氏兄弟夜下龙王庙生死两别离。五十年后,李仁突闻爷爷去世回家奔丧,遭遇一系列离奇鬼异之事,一步踏入盗墓江湖,前路危机四伏暗局迷布,敢问谁能伴我一探究竟?
  • 离奇杀人案

    离奇杀人案

    【本书纯属虚构,如有雷同,纯属巧合】讲述的是一个侦探,接到警局的通知书,说最近出现了一些离奇的案情,时候,在伙伴们的帮助下,成功的侦破案情,却发现还有更大的隐情......
  • 猎龙师的黄昏

    猎龙师的黄昏

    猎龙师出山,但是天下真的有龙么?权谋算尽,一个小小猎龙师何以登堂入室,身居庙堂?二十年前,深宫之中,失踪的婴儿,被送向何方?
  • 鬼夫总裁,轻轻来!

    鬼夫总裁,轻轻来!

    明明只是想找份工作,却被老乡拐进了什么鬼公司啊?面试就给她来个鬼夫!强行跟她啪啪啪也就算了,还逼着她四处游走解决那些冤死鬼的问题,还言之凿凿地说是要她还债??来来来,你们这群神婆神棍同事,老老实实告诉我,这只鬼到底是谁?众人(无辜脸):总裁夫人,不是告诉您了吗?泪奔:为什么别人的霸道总裁都是活的,我的是死的!死的!~
  • 第五人格九魔觉醒

    第五人格九魔觉醒

    揭穿谎言背后的真相和不得不服从的事实证明
热门推荐
  • 我们仍未知道的花名

    我们仍未知道的花名

    一个娇生惯养的冷血公主遇到了一个霸道的花花公子因为某些原因她住到了他的家中二人的同居生活就此开始每天一起上下学的他们将会有怎样的故事时间是否可以治愈一切在她的眼里他到底是什么样的人而他又把她当成了什么……
  • 新时代幻想师

    新时代幻想师

    书名又叫《作为新时代的初代幻想师我好像搞错了什么》续《墨记集》后的时代
  • 天行

    天行

    号称“北辰骑神”的天才玩家以自创的“牧马冲锋流”战术击败了国服第一弓手北冥雪,被誉为天纵战榜第一骑士的他,却受到小人排挤,最终离开了效力已久的银狐俱乐部。是沉沦,还是再次崛起?恰逢其时,月恒集团第四款游戏“天行”正式上线,虚拟世界再起风云!
  • 一路美丽更年期:40岁后女人的健康美丽全书

    一路美丽更年期:40岁后女人的健康美丽全书

    悉心调养捍卫身体健康,精心保养留住美丽风采,宁静心灵造就幸福人生。
  • 素袖迷人,卿本妖娆

    素袖迷人,卿本妖娆

    她可以纯真的像个孩子,亦可以狠毒的像个魔鬼。灭门之仇该不该报?她说“此仇不共戴天!”倘若,她爱的人要她死呢,倘若,她的仇人是她爱的人呢?她在迷茫和徘徊,爱与恨之间,她应该何去何从?冷漠无情,温润如玉,暖若冬阳,狂傲张扬,腹黑如狐……你想要的,他就在那里等你,姑娘,不要怕。你不是说我是个妖女吗?你不是说我爱勾引人吗?那我就妖给你看,那我就勾引人给你看,你不是爱这个江湖吗?那我把这里搅的天翻地覆。可是,在不知不觉中,我已经忘了你的模样,忘了你的容貌,他们迷了我的心,我沦陷在他们给予的温柔之中。我将你的骨灰,洒在这一方土地,在微风中,你抚摸着我的脸颊。
  • 荧惑乱世

    荧惑乱世

    简介:小小美人鱼,没有灵魂,像海水一样无情;声音像其外表一样,具有欺骗性。一出生,耗尽全星之力。十岁第一次历劫,部落消失,自小保护自己的哥哥,死去。拜入师门,师门被灭,师父,死去。收个灵魂,人家本来就死的不能再死。……难道碰谁谁死?好吧,既然活着,既然生命那么漫长,就找点事做吧。
  • 天行

    天行

    号称“北辰骑神”的天才玩家以自创的“牧马冲锋流”战术击败了国服第一弓手北冥雪,被誉为天纵战榜第一骑士的他,却受到小人排挤,最终离开了效力已久的银狐俱乐部。是沉沦,还是再次崛起?恰逢其时,月恒集团第四款游戏“天行”正式上线,虚拟世界再起风云!
  • 异明1561

    异明1561

    嘉靖四十年秋,异变悄然而生……【一号书友群88494583(已满);二号群755248000】
  • 重生俏甜妻养成记

    重生俏甜妻养成记

    堂堂修仙界天机门第三百六十代掌门人穿到贫困落后,吃不饱穿不暖的平行空间——平汉1958年。
  • 大成王

    大成王

    大成王,哈坦大陆五千年前横空出世,刚完成一统大业却神秘消失,只流传下来一句话“谁突破最后的壁垒,谁就是大成王”!几千11来,无数的人倒在了冲向大成王宝座的路上,置身其中的木瓜能否突破自己,成为哈坦大陆第二位大成王呢?