另一方面则是求取科第功名的举子们，也像在大陆一样争奉关公，如嘉庆年间胡应魁撰写的彰化《重修关帝庙碑记》就说：
大矣哉！圣帝之威灵于昭在上，乃垂鉴予小子而示以先几也。魁释褐后，曾任庐州教授；慨文庙倾圯，倡议兴修，颇殚心力。经始时，梦游行宅中，启后户而出，则奇峰秀岭，环列若屏障。其平坦处，清泉漫流，心极爱之。因择无水处散步以遨，神气爽畅。迤迪而南，俄至一庙，堂三楹。楹之右有七、八人，冕而并立；其中之赤面绿袍者，则圣帝也。魁列阶而上，帝已移立堂中。
魁长跪陈列姓名，求问功名所至。语毕，颇悔自列不尽，恐疑为卜科名者。意甫动，帝乃大声言曰：“尔非学官胡应魁乎？尔将来功名所至，问朱大人便知，予日在其前保荐尔。”魁三顿首而谢。见有一人髯而黑，旁跪答拜，心知为周将军，置缨笠于地，谛视之，金色灿然。时乾隆五十七年十月初八夜五更初也。醒而异之，述于所亲，未知作何验。
乾隆六十年谒部选，得闽之德化县；嘉庆元年，调授彰邑。彰自林、陈乱后，庙宇多被焚毁，魁以次兴修。圣帝庙在南门内，倾颓尤甚；乃与贡生郑士模、吴升东等移建于理番署之旧基。己未春兴工，至庚申秋而竣。庙制不尚华饰，而气象之雄壮则大异从前；其方位适当邑署之南，至署后之秀岭清泉，皆予到任时所开凿。接其途径而遥忆之，宛然如在梦中云。
是予幸邀列宪卓荐，荐书六月上旬始出，到部在八月，正朱大人珪署吏部尚书时也。由此日而追溯锡梦时，已阅八年矣。于【余】以知数皆前定，不可豫知。惟此区区之诚，可上邀神明之昭鉴云。爰敬述颠末，志之于碑。
台湾一直视关公为“文衡帝君”，学子考前焚香默祷，考后上供还愿之风习，保存至今：
“苗栗县铜锣乡九湖村武圣庙：此庙立祀文衡圣帝（关圣帝君）。正殿中央即是关帝神像，神像前置一牌位，上书：南宫佑帝君、南天文衡圣帝关之尊、九天司命真君张之神位。左边祀万世师表，上书：大成至圣先师孔夫子、频曾先贤先儒、恩孟杨公先师、伏波将军神位，楹联写着‘金声玉振’，两旁的对联是‘道德参天地、文章冠古今’……此外，尚有清末闻人丘逢甲所书的横匾。虽然位于偏僻的村落里，但它却无古旧的痕，也不似一般庙宇的金壁辉煌，由庙里的摆设可知它的管理极为良善。”
居然将“万世师表”的孔夫子挤在侧位了。而光绪十九年《苗栗县志》记载：
“苗栗县关帝庙：有四。铜锣湾街：光绪十六年（1890年）生员邱国霖、吴汤兴等倡建。”
明明是清末儒学生员捐建的庙宇，却宁可更信关公。说来考生举子虔敬关公，溯根追源，还是来自晚明吏部考选方式的变迁，而在大陆盛行起来的。但台湾能够一直流行不衰，也算是科举时代的孓遗了。
第三就是商贾财神之供，财东商铺开始替代官府，成为复新重建关帝庙的骨干力量。如嘉庆台南《重兴开基武庙碑记》载：
重兴开基武庙，台郡郊、铺、绅士捐金碑记列左：
三郊苏万利、金永顺、李胜兴，各捐银一百元。饷典等、绸缎铺金永和，各捐银三十员。职员朱甘霖捐银二十四员。公源号、本街碗铺圣母、许锺云，各捐银二十员。烟敢郊金合顺捐银十六员。口铺等、药材郊、丝线港圣母、元德居、典吏董其山，各捐银十二员。监生王克荣、许鸣春、油车等、杨梯观、联捷丰、林元美、龚汶观、黄锺岳，各捐银十员。
道辕各房、郭宝兴，各捐银八员。吴德昌、韦启亿，各捐银六员。李昆瑞、林道隆、金盛号、工章贤、苏东盛、林辑伍，各捐银四员。韩锦堂捐银三员。林道记、涌源号、顺发号、如来号、瑞记号、叶振美、源泰号、东庆号、渊源号、联兴号、协成号、蔡拔萃母范氏、李德耀，敬犪米妆圣帝宝像镇殿全座。
本境店主：张慎堂捐银二十二员。薛光耀捐银八员半。朱甘霖捐银八员半。黄本辉捐银六员。许慈观捐银五员半。石鲁千捐银五员半。韩锦堂、合利号，各捐银五员。吴德昌、程才观、杨盘石、长兴号、恒记号，各捐银四员。茶郊圣母、韩世科，各捐银三员半。三夫人、吴天恩、张尚观、洪天僯，各捐银三员。陈助观捐银二两二钱。大使公、俊德观、林海观，各捐银二员半。刘公爷、黄豺观、黄相公、蔡九观、丰临号、陈齐观、新益裕、戴光来、黄钱老，各捐银二员。王蒲观捐银一两三钱。卢雍观、林九观、郭寻观、王六观，各捐银一员半。白番观捐银一两。杨益观捐银一员。顺泰号、盈隆号、吴吉川、叶进扶、长丰号、杨联统，各捐银二员。朝宗号、源泉号、协兴号、杜升观，各捐银一员。
嘉庆二十三年二月（缺）日勒石。
随着政局平稳，生活安定，商人店铺捐赠的手笔也逐渐大方了。姑以台南道光另一座《重修武庙碑记》为例：
月港名区文衡圣殿，增其华者，提宪梁公之懋绩；踵其美者，职员林父之宏猷。然而世远年湮，风飘雨湿，朽镘损坏，雕刻倾颓。不有修葺，何成大观？众等于是捐题镰镒，鸠集僝功：重懋规模，庶乎竹苞而松茂；聿新栋宇，允矣鸟革而翚飞。人力由成，神光默佑，此尤俎豆馨香之所弗替者也！
大学生李应信捐银二百大员。苏源裕捐银一百二十大员。怡成号、长源号、源和号，以上各捐银六十大员。盈茂号、协泰号，以上各捐银五十大员。课馆、锺昆源、恒盛号、东成号，以上各捐银四十大员。泉利号、振合号、丰盈号、新联源、合盛号、义古号，以上各捐银三十大员。惠美号捐银二十五大员。大春号捐银二十四大员。万发号捐银二十四大员。福泉号、合升号、泰隆号、胜记号、欣荣号、慕陶号，以上各捐银二十大员。杨光庇、协源号、惠苑号、林源顺、李升观、泰源号、胜兴号、义源号、李赏观，以上各捐银十六大员。长顺号、新恒顺、吴珍号、长春号、泰昌号、德昌号、寿春号、振盈号、德成号、永和号、林记号，以上各捐银十四大员。翼利号、振隆号、张友芸，以上各捐银十二大员。
道光八年戊子荔月（缺）日榖旦，董事陈学古、曾长源、苏春山、李怡成、林协泰、黄长顺、谢源美，首事李源兴、曾肇期同立。
（副碑）
窃维庙社之兴，有其举之，莫或废焉；况关圣夫子义昭天地，灵震古今，尤宜馨香勿替者也。月港建庙以来，前蒙提宪梁公之踵美，继得职员林老之增华，厥功懋矣！迄今月远年湮，两观之榱题已坏；风飘雨湿，四壁之垣址几倾。非重修而复葺之，曷克壮其观瞻哉？爰鸩僝功，共成众志，恢其旧制，肇厥新规。经始于去岁初秋，落成于今年孟夏。既黝垩以流丹，复钩心而斗角：殿堂峻丽，庶乎鸟革而翚飞；宫阙回环，允矣竹苞而松茂。是事也，虽人力所由成，实神光之默致云！
鹿港原任瓯宁县儒学林文猷捐银一百大员。举人李建邦敬奉旗竿一对。佳里兴分司方振声捐银二十大员。卫守府陈大中捐银二十大员。大学生郭洪辉捐银十六大员。候补分府陈朝琼捐银十大员。头家丁上林助西畔车路一道。
吴尚观、怡隆号、陈论笃、惠圃号、春记号、成玉号、信义号、源盈号、集兴号、协兴号、承源号、珍成号、仁兴号、三合号、咸万号、苏文齐、万珍号、宝成号、苏光前、怡发号、李旺观、荣兴号、义方号、隆兴号、彩云号、曾夙驾、兰苑号、振安号、新盈盛、谢意观、泉春号、源美号、康源号、鼎源号、纪布观、联吉号、芳裕号、李昆源、集香号、振德号、顺发号、绵兴号、杏春号、谢管观、源盈号、昆益号、谢光傅、吉成号、宁顺号、生财号、彩霞号、大振号、隆源号、振发号，以上各捐银十大员。
道光八年戊子荔月（缺）日榖旦，董事陈学古、曾长源、苏春山、林协泰、李怡成、黄长顺、谢源美，首事李源兴、曾肇期同立。两相比较，从1818年到1829年不过十一年，就见出捐资明显呈现出手阔绰，人数众多的特点。七年以后台南“大关帝庙”并非像以前那样都是修旧整颓，而是锦上添花，新增《武庙禳荧祈安建醮牌记》时，参与人数更为众多，一次募集“佛银二千六百九十九元七角四周，总对除用外，尚存佛银一千一百八十一元八角八。”捐赠的这些差别固然与庙宇历史、影响和规模攸关，但也可以看到信众成员的扩大变化，和关庙影响力的大幅提升。又有言：
“关圣帝君除被当做武神供奉外，一般以义相结的商人，因慕关羽的忠义，每于关帝庙里设同业会馆，奉为保护之神。清时府城的‘三郊’、‘六合’为城里商人的两大同业公会，‘三郊’的会馆设在供奉天上圣母的海安宫，‘六合’的会馆则设在祀典武庙。”
随着贸易频繁，人流物转，台湾与大陆关公信仰的情况也几近同步发展，差别缩小。从台湾碑刻看来，嘉庆直到光绪中叶的约百年间，是近代台湾和平发展时间最长的一段时期。台湾与大陆的联系愈加紧密，经济也呈现快速增长的态势，故“唐山过台湾”的移民势头也在逐步增长。殊不料正是台湾开发初显格局，略有小成，引起邻国觊觎，并很快引发了一场战争。这就是“甲午海战”之后，割让台湾，引发了又一场“文化震荡”。此为常识，不说也罢。
从马关签约、台湾被割让的消息传到台湾的那一天起，台湾人民反对日军占领的斗争就从来没有停止过。签约的消息传到台湾，台湾民众掀起了反割台的浪潮，表示“愿人人战死而失台，决不愿拱手而让台”。当条约被正式批准、割台已成为不可避免的事实时，台湾各界人士和广大民众自发组织起来，从日军登陆台湾的第一天起，就进行了顽强的抵抗。由北到南，在五个多月占领台湾全岛的过程中，日军每前进一步都要付出惨重的代价。共有包括近卫师团长北白川宫能久亲王在内的四千八百名日军官兵死亡两万七千人负伤。其伤亡人数比在甲午战争中日军的伤亡人数还要多出近一倍。台湾军民用自己的顽强抵抗显示了中国人民维护国家领土主权完整的顽强意志。
1895年11月，日本首任台湾总督桦山资纪向日本政府报告“今本岛全归平定”。然而，正是从这时起，台湾人民反抗日本殖民统治、争取回归祖国的斗争也拉开了序幕。在1895年至1915年前后长达二十年的武装抗日运动中，台湾各地的民众先后在林大北、陈秋菊、詹振、林李成、胡嘉猷、刘德杓、简义、柯铁、黄国镇、林少猫、林添福、简大狮、詹阿瑞、黄茂松、蔡清琳、刘干、林朝、罗福星、余清芳等爱国志士的领导下，前仆后继，与日本军警展开了殊死战。他们的斗争，许多都以恢复中国对台湾的主权为诉求。其中胡嘉猷的义军公开使用光绪年号，宣称“此次征倭，上报国家，下救生民”；柯铁义军的旗帜上写着“奉清征倭”四个大字；罗福星领导的斗争以“驱逐日人”、“光复台湾”为号召；余清芳领导的噍吧起义也提出了“光复台湾”的口号。
近代中国饱受欺凌，台湾首当其冲。甲午战败，凭借《马关条约》一纸“协议”，台湾成为觊觎已久的日本帝国主义囊中之物。但是台湾军民不甘屈辱，奋起反抗。唐景崧、刘永福、丘逢甲的抗日斗争。
现在的人很少知道，台湾失陷之后，一水之隔的泉州官民曾经举办过一次盛大的召唤游魂超度仪式。王铭铭有一篇《危亡与超生：1896年中国东南沿海的超度仪式》，依据“偶然”得到的一件抄本《泉州承天寺万缘普度》，描述并从社会人类学角度评价了光绪二十二年泉州举行的四十九天全城大法会，以悼念超度甲午战争失败后，日军侵占台湾期间因反抗而战死或遭受杀戮的清军将吏及台湾同胞。最使笔者感兴趣的是，这次集佛道儒、官绅民为一体的大法会，虽然举办地点在佛教承天寺，但却是由通淮关帝庙领衔，且以关圣帝君的名义发起并组织实施的。
关于超度仪式的起因和目的，《南无山海慧自在通王如来榜》一文作了如下明确的说明：
今为大清国福建泉州府晋江县四来等境，共修因果，普度幽冥。翻贝叶之灵音，集刺桐之福荫。念近岁海疆多故，德邑被灾，燹火成墟，兵尘积野。小丑作跳梁之态，大兵扬挞伐之威。旌旗动而日月无光，干盾挥则风云变色。怅一城之骚扰，兽因鸡连；嗟百里之荒凉，龙吟虎啸。犹幸霓旌色壮，拔城还奏凯之师；鸾哕声扬，在泮纪献囚之绩。扫狼烟而开荆棘，谋鸠聚以奠苞桑。固已大地皆春，普天同庆；孰知东征斧钺，一战空还。南国屏藩，三台遽削。相臣功业，独夸割地之能；天意苍茫，未及厌兵之候。至犬羊之小国，恣狼虎之雄威。
台之人世受国恩，久居故土。惜江山之锦绣，耻戎狄之冠裳；剖腹开诚，合义士力图报效。割须潜遁，奈假王莫补空言；兵失掌而势孤，贼乘机而力进。天仞[什]九日，争关后羿之弓；万项惊涛，谁济传岩之楫？无怪干戈气夺，金鼓声虚，迁徒纷纷，死生了了。楚氛甚恶，动教屠毒生灵；秦政日苛，那惜凋残民命。是以沥孤城之血，祸遘睢阳；流四野之膏，惨遭回纥。含冤莫白，抱恨难平。共登枉死之城，愿入无生之路。青磷闪火，夜飘倚树之魂；白骨凝霜，昼作惊人之状。遂使兵戈之气，酿成疠疫之灾。加以青草烟霏，黄茅瘴发，灾星示异，祸水横流。五瘟使衔命而来，百姓家有身如寄。种无名之毒，吾末如何；罹未有之灾，至于此极。考医宗金鉴，空传老鼠之钻；脱国手青禳，谁擅摸龙之术。此即缕悬长命，符佩护身；五木熏汤，百花酿水。要不足扶危济困，挽造化于须臾；起死回生，补阴阳之缺陷。
吾郡犬牙相错，鳞籍联编，纵隔天河，潜通地轴。盼舟车之驾驭，载行旅以往来。彼毒焰之纵横，此恶氛之渐染。桐城内外，毒雾迷天，草野生灵，望风委地。嗟蜉蝣之性命，作鸿雁之哀鸣。所愿五邑名山，引祥云而遍覆；双江流水，化甘露以浓敷。乃集绅耆，共伸诚敬。效周官之逐疫，扫荡妖魔；赛楚国之迎神，肃清尘界。祥轮影射，寒生疠鬼之心；法鼓声沈，擂破游魂之胆。易才占夫且药，诗旋咏乎勿平。苟非得渡世之慈航，仗伏魔之慧剑，何以乘否极泰来之会，立干旋坤转之功乎？
所以通淮关圣帝君目击疮夷，情关屙养。指琼台而下马，垂宝诰于扶鸾。为穷灾害之原，命结因缘之果。意以四郊战垒，英雄半昭沈埋；一纲灾区，生死何关种类？或关山万里，逆旅飘魂；或骨月[肉]一家，捐躯为国。或无儿之伯道，难延一线馨香；或骂贼之铁铉，竟入千秋鼎镬。或廓鸿声于宇宙，红尘堕浩劫之中；或着枭恶于邦家，黑籍隶阴诛之列。凡诸滞魄，共抱沈冤。随劫数以沦胥，讵区分乎兽善。善者知人谁不死，勘破机关；恶者乃忿极而横，酿为妖异。诞登彼岸，非宝筏何以指迷津；普济众生，惟金绳乃以开觉路。故特扫站台之净地，施露泽于承天。
赦命通关，卜九秋之下浣；树幡动鼓，诹十月之初旬。人第见烧爆竹则魑魅皆惊，散香花则魁魔共伏。洗月支之钵，则一城沐而灾消。熏弱水之香，则百里闻而沴祓。不知延沙门之法众，诵天竺之真言。结万善喜缘，广祈多福；度一切苦厄，大开法门。卌九天大会无遮，十八狱幽魂齐脱。更可破三生之孽障，鼓荡天机；开一片之婆心，轮回世界。谕孤魂之等众归女室与男堂，听说法于生公，点头大悟；得传经于天女，合掌鸣恭。发菩提心，省识不生不灭；运广长众，须知即色即空。分香积之清斋，含哺鼓腹；飨伊蒲之法食，义粟仁浆。翘道天堂，借阶梯于宝藏；脱身地府，凭忏悔于金经。晦气既消，祥氛自布；民登仁寿，化洽安平。不必饮鞠酒而延龄，不必服蓬羹而辟疫。不必写锺葵[馗]之影，而群鬼消声；不必悬束艾之符，而百灵效顺。
